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ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro是常用DNF序列分析软件Chromas的Pro版,适用于高达几兆碱基的DNA序列装配项目,以及基本的序列编辑和分析,它能够汇集来自Sanger测序仪(如ABI,454和Illumina下一代测序仪)的数据,如果有8Gb RAM可用,多可达1,000,000个序列,ChromasPro不免费,但是可以免费试用14天。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框图。通过NCBI网站执行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
反向互补序列和色谱图。
通过匹配或优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
系统需求
Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.
It is able to assemble data from Sanger sequencers such as ABI, and 454 and Illumina next-generation sequencers, with up to 1,000,000 sequences if 8 Gb RAM is available. ChromasPro has the following features
科学软件网主要提供以下科学软件服务:
1、软件培训服务:与国内大学合作,聘请业内人士定期组织软件培训,截止目前,已成功举办软件培训四十多期,累计学员2000余人,不仅让学员掌握了软件使用技巧,加深了软件在本职工作中的应用深度,而且也为同行业人士搭建起了沟通的桥梁;
2、软件服务:提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务;
3、解决方案咨询服务:科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务;
4、软件升级及技术支持服务:科学软件网可向用户提供软件的本地化技术支持服务,包括软件更新升级、软件故障排除、安装调试、培训等;
5、行业研讨服务:科学软件网会针对不同行业,邀请国内外以及软件厂商技术人员,不定期在国内举办大型研讨会,时刻关注前沿技术,为国内行业技术发展提供导向。