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Alternative Splicing
DNA microarray is perhaps the most useful technology for splice variant studies. AlleleID® includes the ability to design microarray probes for detecting alternative splicing and gene splicing events.
AlleleID® designs two types of microarray probes that we call junction probes and exon probes, giving the user complete control over the design parameters.
AlleleID® detects the alternative splicing events by designing probes for each junction and/or for each splice variant created.
还包括“小集”选项,帮助您设计小数量的探针集,识别序列,降低总体分析成本。
设计Luminex xMAP试验
基于Luminex’s xMAP技术,AlleleID可以设计应用于悬浮阵列系统的应变-微分多重分析设计。如果您研究的是密切相关的生物体,这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特引物延伸(ASPE)和DHA检测。
多路连接依赖探针扩增(MLPA)检测拷贝数和突变检测
AlleleID是设计MLPA合成探针或者由MRC Holland引入的多重连接依赖探针扩增技术的程序,当合适的工具包不可用时,研究人员能够扩展这项技术。这是一种快速增长的高通量基因图谱分析方法。可以检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。具有成本效益合适、敏感性高、特好和可再生性好等特点。
AlleleID为PamGene检测设计了mRNA特,DNA特和突变特MLPA探针。这将使PamChip用户在使用PamGene高精度检测平台时设计自己感兴趣的基因探针检测。结合这两种技术,拷贝数的变化和突变可以很容易地在6小时内检测到。
Real Time PCR procedure
In a real time PCR protocol, a fluorescent reporter molecule is used to monitor the PCR as it progresses. The fluorescence emitted by the reporter molecule manifolds as the PCR product accumulates with each cycle of amplification. Based on the molecule used for the detection, the real time PCR techniques can be categorically placed under two heads:
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