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北京天演融智软件有限公司

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AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
检测成功的复杂算法
高度特寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set"，该程序具创新性的特点之一，有助于设计少数量的等位基因特寡核苷酸引物和双标记探针，其特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个，降低化验成本。对于类群或跨种分析，当类群或类群高度不同时，该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物，AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种或类群特检测。
广泛支持实时或定量PCR检测和SNP/表达微阵列
AlleleID可以设计优的SYBR Green引物、TaqMan探针、TaqMan Minor Groove Bingding
(MGB)探针、FRET探针或者分子信标，用于实时定量PCR差异基因表达SNP基因型分类试验。您也可以设计实时PCR引物和双标记探针多达一万个序列在一个单一的运行SNP检测或表达微阵列。

Choices for Probe Design: Similarly for probes, when you choose Unique, AlleleID® designs one probe per sequence. When you choose the Minimal set option, AlleleID® designs the smallest number of probes required to identify the sequences.

Although these double-stranded DNA-binding dyes provide the simplest and cheapest option for real time PCR, the principal drawback to intercalation based detection of PCR product accumulation is that both specific and nonspecific products generate signal.

Minimal Set with Unique Primers: Choosing the Minimal set option, AlleleID® designs the smallest number of probes required to identify the sequences. The Minimal set will generally contain fewer probes than the number of sequences to be identified, and a unique combination of probes identifies each sequence. The aim of such an assay is to minimize the synthesis and overall assay costs.
Species Identification: Minimal Set with Unique Primers
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