用于压载水的过滤系统有两种孔径，分别为80微米和10微米。若需进一步减小孔径或增加小孔径筛网，虽然能有效去除海草和大型浮游动物，但去除体积较小的微生物仍显困难。
精细筛网在近海石油工业中广泛应用，其处理量可达每小时5000立方米。建议在压载水泵下游安装一套微过滤器，以减少压载水中的海洋生物。
该微过滤器系统由多个粗过滤器（网孔300mm）和细过滤器（网孔25mm）组成。这些过滤器采用人造纤维制作，具备自动自清洁功能，可适应现有船只或新设计船体。通过编程，过滤器能在设定的时间间隔或压差条件下自动清洁。
粗过滤器和细过滤器的自清洁分别依赖不锈钢刷和真空扫描技术。通常，过滤后的残渣会在装载压载水的港口进行处理，以避免在目的地港口引入非本土生物。
粗过滤主要去除大型浮游动物，而细过滤则进一步滤除较小浮游动物及大、中型浮游植物。无论是300mm还是25mm孔径的过滤器，其处理量均可达到每小时1000立方米。

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