小型喷雾干燥机系统结构包括空气加热系统、供料系统、热风分配系统、雾化和干燥系统、回收系统以及控制系统等。加热系统
工业性的喷雾干燥设备的空气加热形式很多，如蒸汽加热、电加热、导热油加热、燃煤热风炉、燃气热风炉和燃油热风炉等。实验室用的喷雾干燥器由于 干燥所需空气量很少，所以选用了电加热，这样使得设备更紧凑，温度调控便利，而且所需的电耗也少。此外，为了满足生化产品的卫生要求及工艺参数的可调性， 加热系统则包括空气过滤器、电加热器和调压加热等控制装置。
供料系统
工业性生产的喷雾干燥设备的供料系统一般采用螺杆泵加调节装置。而微型喷雾干燥器选用医用蠕动泵，可满足小流量、可调节的要求。
热风分配系统
工业性生产的喷雾干燥设备的热风分配系统采用DAR型、DHS型或直通型，根据雾化方式进行选择，通常对于喷嘴型式雾化的采用直通型热风分配器。对于二流体喷嘴雾化方式 ,采用改进型直通型热风分配器。
雾化系统
本系统包括空气压缩机、雾化器、压缩空气的流量调节等。雾化器包括压力式、二流体及离心式三种。空气压缩机采用增氧泵型，流量调节用转子流量计。
干燥系统
干燥系统主要指干燥室和相关的管路、控制等。干燥室采用耐热玻璃作为干燥室直筒，便于观察，且直观性好，下部采用不锈钢锥体连接，锥体角度不同于工业性生产的喷雾干燥设备的锥体 55°或60°，采用30°锥体以有利于干粉的卸落和增加yi定的干燥流程。在干燥室的进出口管道上装有温度检测及显示仪表。
在食品料滴表面形成的饱和蒸汽膜*进行蒸发，蒸发温度近似等于干燥空气的湿球温度。所设计的干燥室可提供有效的料滴逗留时间，使料滴在不发生 热降解的情况下被干燥。从喷雾干燥器排出的产品温度近似等于25～30℃, 低于干燥空气排出口的温度。在蒸发阶段,雾化形成的料滴分布也是可变的，主要取决于产品要求的外观形状。
回收系统
本系统包括旋风分离器、 增氧泵及产品收集器等。工业性生产喷雾干燥设备的回收系统一般有旋风分离器、 湿式洗涤器和袋滤器等。一般采用两种方式进行物料的有效回收：两处排出，即从干燥室底部和旋风分离器排出;一处排出, 即粉料与干燥空气一起从干燥室排出再经旋风分离器回收。
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