冠状病毒检测技术介绍
新冠状病毒(2019-nCoV)检测目前只有荧光定量PCR方法和测序方法两种被认可的方法。测序不具备快速筛查潜力,这里不做讨论。目前国家药监局审批通过的都是荧光定量PCR的试剂盒。等温扩增的检剂盒,至少已有两个单位开发成功,有望近几天上市。等温扩增的试剂盒上市后,检测速度会大幅提升,检测过程只需要15分钟左右。基本可以满足当下疫情控制要求。
【说明】:鉴于当前技术进步非常快速,这里的信息随时可能会发生变化,请谨慎参考。
对抗当前的疫情,快速检测方法的可以快速确诊病人,快速隔离,快速采取措施。因此,各家科研机构以及相关的企业,特别是体外诊断企业、、大学、研究所以及疾控系统等,在这次新冠状病毒的检测产品开发中,扮演了重要的角色。这里简要介绍一下新冠状病毒的检测技术以及检测产品的开 ** 况。最后,也会给出个人的一点建议,希望对产品开发,以及基金申请选题有所帮助。
一、新冠状病毒相关检测技术
世界卫生组织及国家推荐的检测方法是检测病毒的基因,通过荧光定量RT-qPCR的方法或者是基因测序的方法(1)。其它的方法很难达到实际检测所要求的灵敏度,这里基本不予考虑。测序方法由于比较慢,价格也比较昂贵,适合从事研究但不适合作为筛查手段。检测核酸的方法中,由于这次的新冠状病毒是RNA病毒,所以需要加入一步反转录的过程,再进行PCR扩增。目前的检测方法有荧光定量PCR方法和等温扩增的方法,还有数字PCR技术以及基于试纸检测的方法。还有一些研究的目标是加快样品前处理,提升检测通量,提升检测自动化水平,以及降低对设备的要求,对检测人员的要求和降低成本。目前试剂盒检测的标本主要是咽拭子、痰液、肺泡灌洗液、血清及血浆等。
1、 常规荧光定量PCR方法。目前上市的试剂盒都是基于核酸检测的。较早上市的华大基因的方法,采用单基因检测,前后大约需要3小时。后来,的产品有了一些改进,如多基因检测,或者使用适合快速扩增的酶,都在一定程度上可以提升检测速度。2020年1月28日,*二批获得药监局批准的试剂盒中,圣湘生物采用了*创的RNA一步法技术,灵敏度为200copies/mL,样本处理与扩增检测在一个PCR反应管中即可完成,较大程度减少生物安全风险和交叉污染,可以在30分钟给出结果,这应该是这种方法的极限。而且应该没计算样品处理的时间(2)。
2、 等温扩增法:从原理上讲,等温扩增是较快且灵敏的方法。该方法也是检测病毒的核酸,只是信号放大的策略不同,只需要一个温度就可以了,不需要像常规PCR那样,需要在2~3个不同的温度之间进行循环。等温扩增减少了升降温,反应时间要比常规的PCR快很多,只需要十几分钟。但是,基于这种技术的试剂盒开发要比常规Q-PCR试剂盒复杂一些,涉及多对引物,所以截至今天还没有正式上市的产品。但至少有两个团队已经完成产品开发。
3、 试纸条法(胶体金*层析法):该方法快速方便,优点适合快速筛选,*,不依赖仪器。在病毒浓度低的时候,会导致漏检,获得国家药监局批准的可能性较小。
4、 样品前处理及检测自动化:除了在检测环节提升检测效率之外,缩短样品前处理时间,提升检测通量,提升检测自动化也是一个重要研究方向。
5、 辅助技术开发:如开发能降低检测对环境要求的仪器或试剂。这次所有的检测都必须在P2(二级生物安全实验室)进行。这是一大限制因素,这种实验室建设周期长,审批慢。不可能短时间建成,只能利用现有资源。这也是湖北省每天检测能力受限的重要原因。因此,开发不依赖于P2实验室的检剂和方法,也是当前的一个重要方向。
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