少林寺僧众习武源远流长。早在北魏年间少林建寺初期，即有武装僧众保卫寺庙财产。
到了明代中叶，少林寺棍法已自成一派，寺僧参加了江浙沿海抗击倭寇的战斗，在各路应募兵马中“较为骁勇”，于是声名大震。明朝亡后，一些前朝遗老隐身少林寺，“殚精奋力于技击之练习”，为“灭胡兴汉”之谋。相传顾炎武抗清挫败，曾路过少林寺，作五言长诗追忆少林武僧隋末立功、明代抗倭的功绩，哀叹“岂无材杰人，发愤起颓废”。又传明朝宗室朱德畴入少林寺剃度为僧，后为少林寺主持，号“痛禅上人”。他曾主持制定“少林寺十戒”，**戒即为“肄习少林技击者，必须以恢复中国为志愿，朝朝勤修，无或稍懈。”也许就是这个原因，少林武功在顺治、康熙数十年间，即有“天下武功在少林”一说。当时的武功高手吕四娘、白泰官、马和尚、甘凤池都自诩少林真传。一些反清团体也借重少林寺的声望。《洪门问答》写道：“武从何处学习？在少林寺学习。何拳为先，洪拳为先。有何为证，有拳为证：猛勇洪拳四海闻，出在少林寺内僧，普为天下归洪姓，相扶明室定乾坤。”由此可见，武侠小说中推崇少林寺，绝非妄谈。
少林寺深深陷入武林纠葛，还与它的松散的管理有关。早在明朝时，“中州僧众不纳度牒，今日削发为僧，明日长发为民，任自为之”。白莲教兴起后，少林寺众多俗家弟子踊跃加入，受挫时又回寺避难。社会上一些“长枪大矢、其技较悍”的强人“亦每削发变形入比丘中”。而少林僧人中一些武功高手也经常借募化之机云游四海，到处比武献技。少林寺与江湖武人的双向交流，既丰富了少林武功，又传布了少林的声望。
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