由于实验室的各个设备和技术并不一致，在对废水源头的控制上无法保证万无一失，因此，环境监测实验室必须有效控制废水的排放量，进一步完善废水处理体系。 在此过程中，要做到以下三点： (1)环境监测实验室需要为化学分析实验选择一些能够减少环境污染的实验方法，从废水排放的源头上进行控制。例如，在进行含有酸碱性物质的化学分析实验时，可以检测化学分析后废液中的pH值，利用废酸或废碱综合调节，使调节后的废水能够达到废物利用污染防治方针的要求。 (2)环境监测实验室还需控制化学实验过程中的采样量，使化学分析后的废液能够达到废物利用的要求。 (3)环境监测实验室还需要根据管理环境质量的控制标准，控制一些近期不会用到的化学试剂的购买量，避免化学试剂在存放的过程中变质而影响实验结果，甚至会再次造成废水污染。
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