化妆品微生物污染的重要来源之一，是空气环境，因此应根据生产工艺和产品质量的要求控制车间空气的净化级别，在化妆品生产环境中，化妆品灌装车间的空气一定要按照GMP要求设计，无菌落数不应**过10个为宜。
无尘车间内应选用高效广谱的杀菌方式，可选用的杀菌方式众多，可采用紫外线照射，药物杀菌和过滤除菌等方法，但是每一灭菌方法必须具有:1、高效的杀菌能力。2、低毒或无毒，安全可靠。3、操作过程方便等。
无尘车间的空气过滤是非常重要，主要用于洁净度要求很高的生产车间的空气净化，需要有过滤设备，药物灭菌常用环氧乙烷和甲醛等，用这两种气体灭菌时尚须注意其爆炸极限和允许浓度，紫外线具有很强的杀菌作用，安装简单，使用方便，目前应用广泛。
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