实质不同：

1、过境货物的实质：指他国经本国**运往另一国的货物。包括*装卸而随原运输工具离境的货物和由国外进口后卸载存放，但未经加工转往国外的货物。

2、转运货物的实质：指由境外启运，通过我国境内设立海关的地点换装另一运输工具后，不经过我国境内陆路继续运往其它国家的货物。

3、通运货物的实质：指从境外起运，不通过我国境内陆路运输，运进境后由原运输工具载运出境的货物。

规定不同：

1、过境货物的规定：过境货物运输的过境手续和运价通常在国际运输协定中规定。西方国家过去对这类货物征收进口关税，20世纪以来已取消。目前，许多国家征收少量的准许费、印花费、签证费和统计费。

2、转运货物的规定：运输工具负责人或其代理人在向海关申报转运货物时，必须持有通运或联运提运单据，并在运输工具载货清单或运单上已注明为转运货物。

运输工具负责人或其代理人在出境地海关同时办理货物进出境报关手续，即先出口申报并在报关单注明为转运货物，出口申报后再办理进口报关手续，在进口报关单中注明集装箱号、封志号、出口报关号，较终将进口报关单号填写在出口报关单中。

3、通运货物的规定：运输工具在到达中国**个口岸办理联检手续时，运输工具负责人应向海关申报的《船舶进口报告书》或《进口载货清单》上注明有无通运货物如有通运货物需要在船舶装卸货物时需要倒装，船方则应向海关申请，并在海关监管下通行。

由于国际货物运输的原因，运输工具需中途靠港或降落，其装载的未到达目的国的货物并不卸下，在运输工具完成靠、降作业后出境继续运输。海关对此类通运货物的管理主要是防止通运货物与其他货物的混卸、误卸，监管其继续运往境外。

性质不同：

1、过境货物的的性质：过境货物包括*装卸而随原运输工具离境的货物和由国外进口后卸载存放，但未经加工转往国外的货物。

2、转运货物的性质：转运货物是间接运输的一种。指货物运抵一个港口后，未经加工改制而再运到另一个港口。转口贸易的商品，均为转运货物。

3、通运货物的性质：通运货物自进境起至出境止，属于海关监管货物，未经海关许可不得从运输工具上卸下；运输工具因装卸其他货物需要倒装卸下通运货物时，应向海关申请，在海关监管下进行，并如数装回原运输工具。

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